Topics: Transcriptomics (Illumina)
Origin: Academic
Project type: Expertise
Name of Applicant: Nadhir YOUSFI
Date of application: 12-05-2025
Unit: Genomics
Location: Hôpital Tenon, Bâtiment de Recherche, INSERM U1155, Etage 5, 4 rue de la Chine 75020 PARIS
Phone: 0601370499
@ Mail: nadhir.yousfi@aphp.fr
@ PI-Mail: laurent.mesnard@aphp.fr
Project context and summary: Les microangiopathies thrombotiques (MAT) sont caractérisées, pour certaines d’entre elles, par une activation incontrôlée de la voie alterne du complément du fait de variants gain de fonction de protéines effectrices ou perte de fonction de protéines régulatrices. L’objectif du projet sera de déterminer l’expression (si possible de manière allèle-spécifique) des gènes de la voie alterne du complément et de comprendre certains mécanismes de régulation. Pour cela, nous allons analyser le transcriptome de souris contrôle et traitées par sérum néphrotoxique (induisant des lésions de MAT) de fond génétique différent (Sv129 et C57BL/6J) à partir de tissu rénal. Nous nous attendons à un statut d’expression génique différent selon les différentes conditions expérimentales.
Related team publications:Yousfi N, Mousseaux C, Hamza A, et al. Genomic analysis of adult thrombotic microangiopathies in less than 3 days : from rapid to fast genomics to treatment. Blood. 2024 ; 144 (21) : 2266-2269. doi : 10.1182/blood.2024024976.
Bensouna I, Robert T, Vanhoye X, et al. Systematic Screening of Autosomal Dominant Tubulointerstitial Kidney Disease – MUC1 27dupC Pathogenic Variant through Exome Sequencing. J Am Soc Nephrol. 2024. doi : 10.1681/ASN.0000000503
Doreille A, Rafat C, Rondeau E, et al. How I treat thrombotic microangiopathy in the era of rapid genomics. Blood. 2023 ; 141(2) : 147-155. doi : 10.1182/blood.2022015583
Manager: iakov.vitrenko@pasteur.frStatus: Kick-off meeting