Le cancer colorectal (CCR) est le 3e cancer le plus fréquent chez l’homme et le 2e chez la femme en France et dans le monde. Il représente la 2e et 3e cause de mortalité par cancer dans la population française et mondiale respectivement. Le cancer est une maladie qui se caractérise par une multiplication incontrôlée des cellules au sein d’un organe ou de l’organisme, résultant d’une interaction entre des facteurs génétiques, comportementaux (mode de vie, régime alimentaire) et environnementaux. Pour ces derniers, la contribution du microbiote intestinal est maintenant avérée et fait l’objet de nombreuses études mécanistiques pour en comprendre les bases.
Au laboratoire, nous nous intéressons aux souches pathogènes (pathobiontes) de la bactérie E. coli, qui peuvent coder plusieurs facteurs de virulence et toxines agissant sur les cellules de l’hôte tout en résidant dans l’intestin sans y provoquer de manifestations aigues (comme les diarhées). Plusieurs études, dont celle de notre équipe, montrent un enrichissement de ces E.coli dans le microbiote de patients atteints de CCR en comparaison de témoins. Notre hypothèse est que des E. coli pathogènes porteuses de certaines toxines et facteurs de virulence stimulent des voies pro-oncogéniques au sein de l’épithélium. Nos travaux expérimentaux nous ont permis de caractériser l’activité enzymatique de la toxine CNF1, les cibles cellulaires eucaryotes : les GTPases de la famille Rho, ainsi que certains mécanismes de réponse de la cellule normale de l’hôte pour maintenir l’intégrité du génome et une homéostasie tissulaire lorsque ces voies sont exacerbées. Nos travaux, soumis pour publication, montrent que la toxine CNF1 est responsable d’un changement d’identité des cellules souches adultes de l’épithélium intestinal et colique vers un état de type fœtal, par modulation transcriptomique. De telles signatures transcriptomiques sont retrouvées dans des sous-types de cancer colorectaux.
