Les agents pathogènes d’origine alimentaire sont un sujet majeur en santé publique du fait de leur incidence et des conséquences qu’ils ont sur la santé humaine. Le séquençage Nanopore® offre de nouvelles possibilités de détection de ces agents pathogènes. Nous souhaitons effectuer un premier test de séquençage 16S sur diverses matrices alimentaires contaminées ou non par des bactéries pathogènes afin de valider la détection des matrices contaminées et quantifier l’agent pathogène.
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