Status: Quotation sent
La rhizosphère est une zone très importante dans les écosystèmes terrestres où se déroulent des interactions complexes entre micro-organismes et racines, notamment entre les champignons mycorhiziens et les protistes. Une expérience en microcosmes a montré que Rhizophagus irregularis et Acanthamoeba castellanii agissent en synergie sur l’assimilation racinaire de l’azote par le blé d’hiver (Henkes et al., 2018). R. irregularis est une espèce de champignons arbusculaires, du groupe des Gloméromycètes, qui s’associent avec la plupart des herbacées. A. castellanii est une espèce de protistes du groupe des Amoebozoa, ubiquistes dans les sols. D’une manière générale, les protistes sont des acteurs-clés de l’absorption de l’azote par les hyphes extra racinaires des Gloméromycètes (Vaishnav et al., 2025) et sont plus diversifiés en termes d’ASV à la surface des hyphes que dans le sol environnant (Zhang et al., 2024). Si les champignons arbusculaires et les protistes agissent en synergie, ils sont aussi complémentaires. Le stage cherchera donc à réaliser cet inventaire sur les toits végétalisés de Paris, complété par les analyses physico-chimiques de facteurs déterminants comme le phosphate ou le pH. Le choix des toits se basera sur le rapport Grooves qui avait exploré la biodiversité de toits végétalisées à Paris intramuros et la petite couronne entre 2017 et 2019. Le ou la stagiaire devra échantillonner différentes espèces d’herbacées dans des toits de type extensif et intensif. A partir de l’ADN extrait sera fait le métabarcoding des champignons par GENOSOL et celui des protistes par la plateforme BIOMICS de l’Institut Pasteur à Paris, qui participe déjà à l’inventaire des protistes.
Submitted: 2025-06-18 10:17 · Last updated: 2025-06-18 10:17